Разнообразие микроорганизмов темно-каштановой почвы Западно-Казахстанской области и их оценка

Abstract

В статье приведены результаты исследований структура почвенного микробиома и их содержание в темно-каштановах почвах Западно-Казахстанской области. Почва для микроорганизмов является сложной системой и на состав бактериальных сообществ сухо-степных почв влияют такие факторы, как содержание органического вещества, рН, влажность, доступность питательных веществ, температура и другие. Для молекулярно-генетического анализа микробных сообществ почв важным шагом стало появление молекулярного метода высокопроизводительного секвенирования, т.е. исследование и сравнение последова-тельностей ДНК библиотек таксономически значимых генов (16S рРНК), геномов отдельных организмов или совокупности геномов организмов в образце. Количественную оценку ДНК бактерий и архей почвенных образцов проводили, используя ПЦР в реальном времени (real-time PCR). Для бактерий контрольным вариантом использовали клонирование фрагмента рибосомного оперона Escherichia coli (Sigma), для архей – штамма FG-07 Halobacterium salinarum. В результате проведенных исследований (таблица 1) в профиле почв выделенное микробное сообщество состоит из доминирующих представителей фил 9 бактерий Proteobacteria, Acidobacteria, Actinobacteria, Verrucomicrobia, Bacteroidetes, Chloroflexi, Planctomycetes, Gemmatimonadetes и Firmicutes, другие присутствующие в почве бактерии занимают малые доли в общем количестве.